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R语言及Bioconductor在基因组分析中的应用 内容提要 |
《R语言及Bioconductor在基因组分析中的应用》是国内第一本系统介绍R语言及Bioconductor软件包的图书。R语言是一种计算机程序设计语言,也是一个开放式的软件开发平台。R语言具有强大的数学统计分析和科学数据可视化功能,能提供各种数据处理、统计分析及图形显示工具。软件研究人员可以在R语言这个开放平台上不断扩充其功能,开发出面向特定应用的软件。Bioconductor就是一个基于R语言的、面向基因组信息分析的应用软件集合。Bioconductor的应用功能是以包的集成形式呈现在用户面前,它提供的软件包中包括各种基因组数据分析和注释工具,其中大多数工具是针对DNA微阵列或基因芯片数据的处理、分析、注释及可视化的。同时,Bioconductor还提供许多与DNA微阵列相关的数据包。 《R语言及Bioconductor在基因组分析中的应用》面向计算机应用人员,可供从事数学统计分析和生物信息学研究及应用的有关人员参考。 |
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R语言及Bioconductor在基因组分析中的应用 目录 |
前言 上篇 R语言 第1章 R语言简介 第2章 R语言的基本数据结构 第3章 R语言对象 第4章 分组因子 第5章 数组和矩阵 第6章 数据列表和数据单 第7章 导入导出数据 第8章 组合表达式和控制语句 第9章 函数 第10章 包 第11章 R语言中的统计 第12章 图形函数 下篇 Bioconductor及其应用 第13章 Bioconductor与DNA微阵列数据处理 第14章 Bioconductor的使用 第15章 数据库访问 第16章 图形及用户接口 第17章 图结构 第18章 通用工具 第19章 注释 第20章 基因本体学 第21章 微阵列数据预处理 第22章 数据分析 第23章 微阵列比较基因组杂交 第24章 蛋白质组学 主要参考文献 附录 R语言常用功能一览表 |
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